微流控設備的優點，主要有以下五個方面：

（1）集成小型化與自動化

微流控技術能夠把樣本檢測的多個步驟集中在一張小小的芯片上，通過流道的尺寸和曲度、微閥門、腔體設計的搭配組合來集成這些操作步驟，最終使整個檢測集成小型化和自動化。

（2）高通量

由于微流控可以設計成為多流道，通過微流道網絡可以同時將待檢測樣本分流到多個反應單位，同時反應單元之間相互隔離，使各個反應互不相干擾，因此可以根據需要對同一個樣本平行進行多個項目的檢測。與常規逐個項目檢測相比，大大縮短了檢測的時間，提高了檢測效率，具有高通量的特點。

（3）檢測試劑消耗少

由于集成檢測的小型化，使微流控芯片上的反應單元腔體非常小，雖然試劑配方的濃度可能有一定比例的提高，但是試劑使用量遠遠低于常規試劑，大大降低了試劑的消耗量。

（4）樣本量需求少

由于只在小小的芯片上完成檢測，因此需要被檢測的樣本量需求非常少，往往只需要微升甚至納升級別。此外還可以直接用全血進行檢測，對于嬰兒、老人、殘疾人這些血量少、靜脈采集困難的人群，使其檢測更加方便；或者是非常珍貴稀少的樣本，使其多項指標檢測成為可能。

（5）污染少

由于微流控芯片的集成功能，原先在實驗室里需要人工完成的各項操作全部集成到芯片上自動完成，使人工操作時樣本對環境的污染降低到最低程度。例如在分子核酸類檢測中，無論是樣本本身，還是制備后準備用于檢測的核酸，均會對實驗室造成污染，氣溶膠的擴散使得后續樣本檢測容易出現假陽性。